Основные объекты учёта ИС:
- Случаи инфекционных болезней как человеческого происхождения (индивидуальные и общие), так и животного происхождения, которые регистрируются в ИС на основе документов: бумажных документов, электронных документов, передаваемых в ИС (снаружи) с внешних носителей;
- Направления на лабораторные анализы и их результаты.
- Централизованный учёт данных всех случаев инфекционных заболеваний в стране;
- Централизованный учёт сообщений об очаге инфекции у людей;
- Централизованный учёт сообщений о случаях инфекционных заболеваний у животных и птиц;
- Создание единой базы данных случаев инфекционных заболеваний;
- Оперативный поток данных в заинтересованные службы;
- Выполнение оперативного и ретроспективного анализа эпидемиологической ситуации.
- Периодическую подготовку информационно-аналитических материалов для проведения оперативного анализа эпидемиологической ситуации;
- Периодическую подготовку информационно-аналитических материалов для органов исполнительной власти;
- Подготовка государственного статистического учёта.